毛百合LiGPAT基因3’端与5’端克隆及序列分析  

相恒佐1* , 王宗禹1* , 陈丽静1 , 张丽1 , 林景卫1 , 赵兴华2 , 李天来1
1 沈阳农业大学, 辽宁省生物技术重点实验室, 设施园艺省部共建教育部重点实验室, 沈阳, 110866;
2 辽宁省农业科学院, 沈阳, 110161
*共同第一作者
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 24 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000831
收稿日期: 2012年12月07日    接受日期: 2013年06月20日    发表日期: 2013年11月04日
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摘 要

利用 3’和5’末端快速扩增(3’ RACE和5’ RACE)技术的方法成功克隆了毛百合(Lilium dauricum Ker Grawl)甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase, GPAT) 基因3’和5’末端序列,分别得到了长度为777 bp和496 bp的片段。通过与已发表的LiGPAT 保守区基因序列(Genbank登录号为HQ654523)拼接,得到得到基因全长 cDNA 共1 544 bp,其中5’-UTR 10 bp,ORF区1 233 bp,3’-UTR 311 bp 并含有19 bp的poly(A)尾巴,编码410个氨基酸,预测分子量大小为45.9 KDa。此序列Genbank登录号为JX524741。在NCBI上进行BlastP比对分析,发现LiGPAT基因推导的氨基酸序列与油棕(Elaeis guineensis)的相似性最高,达76.7%。其次是沙棘(Hippophae rhamnoides)73.2%,柑橘(Citrus unshiu)67%,南瓜(Cucurbita moschata)66.8%,蓖麻(Ricinus communis)66.1%,麻风树(Jatropha curcas)65.9%,水稻(Oryza sativa)64.5%,红花(Carthamus tinctorius)63.5%。与莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)同源性较低,仅为40.8%。

关键词
毛百合;GPAT;RACE;基因克隆;序列分析
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《分子植物育种》印刷版
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